nrStar? Human tRF&tiRNA PCR芯片

  • 描述
  • 芯片特点
  • 工作流程
  • 数据库
  • 说明书
  •        作为一种新型的tRNA来源的非编码小RNA,tRF& tiRNA由精确调控的生物发生过程所产生,参与行使多种生物学功能: 作为microRNA参与RNA干扰;调节靶向mRNA的稳定性;在细胞应激条件下促进应激颗粒(SG)的组装;调控细胞凋亡[1];作为表观遗传因子在世代间传递[2,3](图1)。tRFs& tiRNA的组成和含量高度依赖于细胞类型,并且与多种病理状态密切相关。它们在生物体液中广泛存在,含量远超microRNA,使之有望成为极佳的分子标志物[4-7]。
           Arraystar公司最新发布的nrStar? Human tRF & tiRNA PCR Array包含了185类来自权威数据库收录和最新文献报道的tRF或tiRNA,方便客户对tRF & tiRNA进行简单快捷地表达谱分析。

           由于tRF & tiRNA片段很短,且序列与其前体tRNA十分相似,常规的引物设计难以完全区分二者。为了保证最佳的特异性,Arraystar创新性的采用双端接头法,在tRF & tiRNA的3’和5’端分别引入了一段人工合成序列,并针对跨连接点区域设计引物,从而获得唯一性的PCR扩增产物(图1)。另外,每一步qPCR流程都经过了精心优化和严格测试。每块板都设置了Spike-in对照、PCR阳性对照、基因组DNA对照和看家内参对照,确保了最高的数据质量。

    图1. 双端接头法保证了tRF & tiRNA PCR产物的高特异性


    产品列表

    产品名称 物种 规格 描述
    nrStar? Human tRF&tiRNA PCR Array Human 1 plate (2 x192) 包含185类来自权威数据库收录和最新文献报道的tRF或tiRNA
  • ● 前沿—近年来tRF & tiRNA研究呈井喷式的增长
    ● 专注—专注于出现频次高、生理病理关联性强的tRF&tiRNA类群
    ● 严谨—每一对qPCR引物都经过精心地优化和严格地测试
    ● 便捷—随取随用,极致便捷;标准qPCR板型直接测样,无需预扩增

  • 适用实时荧光定量PCR仪:
    ABI ViiA? 7, ABI 7500 & ABI 7500 FAST, ABI 7900HT, ABI QuantStudio? 6 Flex Real-Time PCR system, ABI QuantStudio? 7 Flex Real-Time PCR system, ABI QuantStudio? 12K Flex Real-Time PCR System, Bio-Rad CFX384, Bio-Rad iCycler & iQ Real-Time PCR Systems, Eppendorf Realplex, QIAGEN Rotor Gene Q 100, Roche Light Cycler 480, Stratagene Mx3000, Roche Light Cycler 480 

  • Human tRFs & tiRNAs (185)[7,8] 
    5001A, 5001B, 5002A, 5002C, 5003/4B, 5003/4C, 5005A, 5005B2, 3001A, 3002B, 3004A, 3004B, 3006B, 3031B, 3033A, 3030A, 3030B, 3016A, 1001, 1003, 1004, 1005, 1006, 1007, 1010, 1012, 1013, 1015, 1020, 1023, 1024, 1025, 1026, 1027, 1028, 1029, 1030, 1031, 1032, 1033, 1035, 1036, 1037, 1038, 1039, 1040, 1041, 1042, 5002B, 5005B, 5005C, 5007A, 5007C, 5008B, 5008C, 5009A, 5009B, 5009C, 5010A, 5011A, 5012B, 5013B, 5013C, 5015/17A, 5016A, 5016C, 5017B, 5017C, 5019A, 5019B, 5020/21A, 5020B, 5020C, 5021B, 5022A, 5022B, 5023A, 5023B, 5024A, 5026A, 5026/27B, 5026/27C, 5028/29A, 5028/29B, 5028C, 5030B, 5030C, 5032A, 5032B, 3002A, 3003A, 3003B, 3006A, 3008A, 3008B, 3009A, 3009B, 3010/11/12/13/14B, 3011/12A, 3013A, 3014A, 3015A, 3015B, 3016/18/22B, 3017A, 3018A, 3017B, 3019/20/21B, 3023B, 3024/25/29B, 3026B, 3027/28B, 3019A, 3020/21A, 3022A, 3026/27/28A, 3029A, 3031A, TRF21-26, TRF62, TRF63, TRF23, TRF204, TRF205, TRF208, TRF214/215, TRF223, TRF250, TRF272/274, TRF273, TRF293/294, TRF303/304, TRF305/306/307, TRF308, TRF312, TRF314, TRF315, TRF316, TRF318, TRF320, TRF321, TRF322, TRF323/324/326, TRF325, TRF327, TRF330, TRF337-339, TRF345, TRF346, TRF347, TRF351, TRF352, TRF353, TRF354, TRF356/359, TRF360, TRF368, TRF366, TRF365, TRF373, TRF374, TRF375, TRF393, TRF396, TRF398, TRF417, TRF419, TRF422, TRF457, TRF460, TRF462, TRF463, TRF466/468/469/471/472/473, TRF490, TRF492, TRF493, TRF511, TRF522/523/525, TRF524, TRF533/534, TRF537, TRF539, TRF546/547, TRF550/551, TRF552
     
  • 康成使用Arraystar的芯片为客户提供服务,以下为相关资料:

    产品说明书:adobe_pdf_smallManual_nrStar_Human_tRF_tiRNA_PCR_Array_v1.04

    产品说明书:adobe_pdf_smallManual_rtStar First-Strand cDNA Synthesis Kit Manual (3' and 5' adaptor)_v1.07

    工具: excelAnalysis_Tool_for_nrStar?_Human_tRF_tiRNA_PCR_Array_v1.01