tRF&tiRNA测序

  • 简介
  • 产品特点
  • 结果展示
  •       tRFs和tiRNAs是tRNA及其前体通过精确调控的加工过程产生的,作为小非编码RNA行使多种生理功能,与诸多生理病理过程相关(图1)。据报道,tRFs&tiRNAs能够以microRNA的方式参与RNA干扰;结合蛋白因子并调节目标mRNA的稳定性;与细胞色素C互作,调控细胞凋亡;改变胚胎转录级联调控,作为父本表观遗传因子介导代谢疾病遗传;多种应激条件下促进应激颗粒的组装。

          tRF&tiRNAs的组成和数量高度依赖于具体的细胞类型和病理状况,使得它们成为一类极佳的生物标志物[1]。例如,tRFs&tiRN-As之间的比例关系能够作为癌症存活期指标和潜在的诊断标志物[2]。同时,相比其他microRNA,tRNA和tRFs&tiRNAs类群广泛富集于各种生物体液中[3-4]。


     

    图1. tRFs&tiRNAs功能及相关疾病

    康成生物tRF&tiRNA测序服务提供从样品到数据的全套解决方案。根据我们tRF&tiRNA测序和表达谱分析中得到的丰富信息,按照tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们?中提供的方法及应用,科研工作者们能够更便捷地推进他们在这个新兴领域的研究工作。


    参考文献 

    1. Telonis A.G. et al. (2015) "Dissecting tRNA-derived fragment complexities using  personalized transcriptomes reveals novel fragment classes and unexpected dependencies." Oncotarget 6(28):24797-822 [PMID: 26325506]

    2. Olvedy M. et al. (2016) "A comprehensive repertoire of tRNA-derived fragments in prostate cancer." Oncotarget [PMID: 27015120]

    3. Schageman J. et al. (2013) "The complete exosome workflow solution: from isolation to characterization of RNA cargo." Biomed Res Int 2013:253957[PMID:24205503]

    4. Dhahbi J.M. et al. (2013) "5' tRNA halves are present as abundant complexes in serum, concentrated in blood cells, and modulated by aging and calorie restriction." BMC Genomics 14:298 [PMID: 23638709]



  • 1. 性能优化的测序方法与严格的质控过程
    2. 使用Arraystar独家授权的"tRF & tiRNA Analysis System"
        ?基于tRNA拓扑结构和统计显著性的精准注释与分类系统
        ?全面的tRFs&tiRNAs数据库信息
        ?tRFs&tiRNAs专注的生物信息学与统计学分析
    3. 额外的miRNA表达和差异分析 
    4. 出版级的数据和图表展示 
    5. 无缝链接tRNA系列服务:tRNA-seq、tRF&tiRNA PCR array和tRNA PCR array

  •        为了更好地了解tRFs及tiRNAs的生物学特征,促进它们在生物标志物方面的应用,tRF&tiRNA-seq提供了丰富的生物信息学分析。额外福利:其他microRNA的表达分析也包含其中!
    1.表达及差异表达谱


     

    图2. 表达及差异分析数据表


    2.详尽的注释信息


     

     

    图3. 详尽注释的tRF&tiRNA序列、家族、二级结构以及剪切位点


    3. tRF&tiRNA在4种小RNA类型中的分布

     

    图4. tRF&tiRNA与其他相似尺寸小RNA之间的相对含量关系,在多种组织中,tRF&tiRNA的占较高甚至主要比例,这强烈预示了其重要的生理功能和生物标志物应用潜质。